Thursday, September 27, 2012

Geben Sie die Wettbewerbe: Im vergangenen Jahr Ich habe ein iPad2. Ich betrat fast jeden Wettbewerb




Einige Kommentare und Analysen travel guide to amsterdam aus der spannenden und schnelllebigen Welt der Genomics. Dieser Blog konzentriert sich auf Next-Generation-Sequenzierung und Microarray-Technologien, obwohl es wahrscheinlich zu gehen auf Tangenten von Zeit zu Zeit ist
Der 2013 AGBT Treffen läuft vom 20. bis zum 23. Februar travel guide to amsterdam und, wie immer, ist im sonnigen Marco Island, Florida. Dieses travel guide to amsterdam jährliche Treffen ist derjenige, der für Durchsagen um neue Genomik-Technologien zu beobachten. Letzten Jahren heißes Thema war Oxford Nanopore Ankündigung von Minion (obwohl niemand scheint Kopf nichts, da haben). Was wird die Zahl eine Geschichte in diesem Jahr? Nun, die 2013 Treffen hat einen verstärkten Fokus auf klinische Anwendungen travel guide to amsterdam der NGS, vielleicht GnuBio wird jeder mit ihrer Technologie begeistern, oder vielleicht jemand über tolle Methoden zur Analyse von zirkulierenden Tumor-DNA zu sprechen? ;-) Kaufen Sie Ihren Lottoschein Kürze:
Anmeldung öffnet am 1. Oktober und in diesem Jahr alle Anwendungen werden in einem Clearing-System gehen, um die 1000 oder so verfügbaren Plätze vergeben. Einer der häufigsten Kritikpunkte der Nutzer ist die Registrierung. AGBT in 2011 2012 in einer Angelegenheit von Stunden, die wissenschaftliche Äquivalent aa Stone Roses Konzert ausverkauft! Dies ist nicht die Organisatoren der Konferenz Schuld, sondern zeigt, wie wichtig das Treffen für Benutzer travel guide to amsterdam von NGS ist.
Es ist vielleicht auch etwas mit dem Sein in Florida im Februar zu tun. Sonne, Meer und ASTA anyone? Die Organisatoren gehen, um die Anzahl travel guide to amsterdam der Teilnehmer aus den einzelnen Labors und Institute zu begrenzen, so erwarten Argumente Broad, Sanger und WashU im Dezember. travel guide to amsterdam Die Anmeldung beinhaltet die Treffen, Hotelkosten und Verpflegung und die legendäre travel guide to amsterdam AGBT Partei. Im vergangenen Jahr ein post-doc war dort in einer hausgemachten Storm Trooper Kostüm, dass die Kosten über $ 1000. Ich bin nicht sicher, was das Thema in diesem Jahr ist, aber Sie können mehr nerdy Spaß erwarten.
Geben Sie die Wettbewerbe: Im vergangenen Jahr Ich habe ein iPad2. Ich betrat fast jeden Wettbewerb gehen und es gab mehr als 20 große Preise travel guide to amsterdam angeboten, darunter iPads, Apple TV s, etc. Die Chancen stehen ziemlich gut mit rund 1000 Teilnehmern und die meisten nicht die Mühe zu geben.
Nehmen die Parteien: letzten Jahren Parteien waren so gut wie gewohnt. Viel Auswahl zu bieten und Agilents Videowand war fantastisch. Eine große Kopfschmerzen mit AGBT ist die Unterhaltung zu bieten, soll ich arbeiten am nächsten Tag um Himmels willen! Oh well Sie immer auf dem Flugzeug nach Hause schlafen.
travel guide to amsterdam Nachholbedarf in der Bar: AGBT ist ein großartiger Ort, um sich mit Kollegen Sie nicht für Alters gesehen haben. Jeder ist in Feierlaune und in der Regel von den pre-AGBT Ansagen aufgeregt. Viele Ideen umgehen schwebte und wer weiß Ihre nächste große Zusammenarbeit könnte bei einem Bier beginnen.
Don t vergessen Tasche: jeder bei AGBT endet mit der gleichen Tasche als sie geben einen außergewöhnlich travel guide to amsterdam guten ein Vergleich zu den meisten Konferenzen (jetzt weiß ich, wo meine 2400 $ Anmeldegebühr geht). Wirte Ihren Namen in Ihrem Notebook oder eine andere Tasche für das Tragen rund um die Sitzung, da es zu einfach ist, erhalten Sie Ihr durcheinander und verlieren alle Ihre Notizen.
Folgen Sie der Konferenz on-line: MassGenomics, EdgeBio, Core-Genomics, Jonathan Eisen Blog, schaftlich Sprechen, Krankheitserreger Genen und Genomen hatten alle Deckung, wenn Sie nicht könnte es oder nehmen und dont CrapBio vergessen, war es # notAGBT Ankündigung das Lachen der AGBT. Twitter wird wieder die # AGBT zu folgen.
Don t vergessen, die Sonnencreme: Es war heiß im letzten Jahr und im Meer schwimmen war sicherlich das Gebot der Stunde. Es ist Februar habe ich nicht einmal denken, Sonnencreme zu bringen, aber zum Glück habe ich glaube nanomechanische versagte kleine Pumpen SPF50. Wer will mit nach Hause Sonnenbrand gehen!
Blogging und twittern: Ich habe versucht Blogging durch die gesamte Sitzung im letzten Jahr und ich bin nicht sicher, ob ich werde wieder versuchen. Es ist harte Arbeit macht schnell gekritzelten Notizen verständlich für ein breiteres Publikum und es dauerte zu lange. Zeit konnte ich in der Bar verbracht haben! Es gibt sehr klare Konzeption für Blogging oder twittern auf der diesjährigen Tagung, obwohl die im vergangenen Jahr gehen die meisten Lautsprecher sind glücklich, die Abdeckung zu erhalten. travel guide to amsterdam Ich sah einen großen Anstieg der Leser meines Blogs und Core-Genomics über 10.000 Seitenaufrufe travel guide to amsterdam im Februar erhalten. Vielen Dank an alle, die kommentiert.
Änderungen an AGBT: Eine wirklich lästige Problem mit AGBT (und alle parallelen Sitzung Sitzungen) ist die unvermeidliche travel guide to amsterdam Überschreitung der Gespräche, würde stärkere Vorsitz und Zeitmessung wirklich in Bewegung zwischen den Sitzungen, um alle Gespräche die Sie hören möchten fangen helfen. Es gab Hunderte von Plakaten im letzten Jahr, viel zu viel sogar vorbei. Es wäre toll, wenn diese alle waren online, downloadbare und durchsuchbare ein paar Wochen vorher, so konnte travel guide to amsterdam ich organisieren, um mit der Person, die das Plakat mit spezifischen Fragen zu sprechen. Es würde auch helfen, wenn sie wurden unter verschiedenen Themen mit Tags irgendeiner Art gesammelt. Ich würde gerne sehen, mehr Menschen aus der Dritten Welt in diesem Jahr. NGS ist nicht nur für die Reichen (obwohl es hilft, ein paar $ Mio.). Ich möchte auch eine Sitzung für Core Facility Labors, travel guide to amsterdam vielleicht durch ABRF ausgeführt haben. Im Gespräch mit anderen zentralen Labors ist immer nützlich, auch wenn es hilft, nur um mich zu beruhigen, dass ich nicht die einzige Person, die vor besonderen Problemen. Wir sehen uns dort (hoffe ich). PS: Wenn jemand will, um ein Zimmer im nächsten travel guide to amsterdam Jahr Treffen Aktien zögern Sie einen Kommentar hinterlassen. Doppelbelegung spart mein Budget eine Menge Geld und als mein Labor durch öffentliche Spenden finanziert wird I don t sehen keinen Grund nicht zu teilen. Bitte don t gelten, wenn Sie schnarchen!
CoreGenomics ist eine persönliche Blog von James Hadfield, die eine Genomics Core Facility Cambridge läuft geschrieben. Der Kern läuft viel der nächsten Generation travel guide to amsterdam Sequenzierung und Gen-Expression Microarrays neben anderen Genomic-Technologien.
Die Aussicht von James in diesem Blog ausgedrückt sind seine eigenen. Jede Ähnlichkeit mit den Ansichten von jemand oder einer Organisation, sind lebendig, tot oder untot ganz zufällig. Seine Ansichten wahrscheinlich nicht die Meinung anderer zu CRUK obwohl er möchten hören, wenn sie es tun! Kurze Bio: James erhielt Studium der Biologie an der Universität von East Anglia in 1995. Seiner bisherigen Karriere hat beugte sich zu der technologischen Entwicklung oder Umsetzung. Im Jahr 1995 entwickelte er eine differentielle PCR Test für ErbB2 Kopienzahl Analyse auf der gleichen Zeit wie real-time PCR kam, eine schlechte Wahl im Nachhinein! Norfolk Norwich Hospital auf ErbB2, Royal London travel guide to amsterdam am Diabetes Genetik, Cambridge Uni Department of Pathology am Immunologie und der John Innes Centre an Weizen Krankheitsresistenz-Gen Klonen und Arrays, über die letzten 16 Jahre hat er gearbeitet habe. In 2000 war er der Einrichtung eines Affy und gefleckten Microarray Facility am JIC, war er Mitbegründer der britischen travel guide to amsterdam Affy Benutzergruppe, die immer noch stark ist. Am JIC gewann er auch einen Biotech Wettbewerb, und hofft, einen Tag, um ein Geschäft zu starten. Obwohl keines seiner Ideen haben, etwas kommen noch! Im Jahr 2006 James zog die Einrichtung der Genomik Anlage bei CRI. Das Labor bietet breites Spektrum genomische Dienstleistungen für Wissenschaftler CRI und Illumina Next-Gen-Sequenzierung für CRI, Gurdon, LMB und Pflanzenwissenschaften. James hat zwei Kinder und lebt in Norfolk, die viel näher an der Küste als Cambridge. Publikationen von James Hadfield: Curtis et al. Die genomische und Transkriptom travel guide to amsterdam Architektur 2000 Brusttumoren zeigt neue Untergruppen. Nature 2012. Aldridge und Hadfield. Einführung in die miRNA Profiling Technologies und Cross-Plattform-Vergleich. Methods Mol Biol 2012; 822:19-31. travel guide to amsterdam Massie et al. Der Androgenrezeptor Kraftstoffe Prostatakrebs durch Regulierung zentralen Stoffwechsel und Biosynthese. EMBO J. 2011 20. Mai. Holmes et al. Breast Cancer travel guide to amsterdam Special Feature: Transducin-like Enhancer protein 1 vermittelt Östrogen-Rezeptor-Bindung und transkriptionelle Aktivität in Brustkrebszellen. Proc Natl Acad Sci USA. 2011 2. Mai. Katsnelson et al. Genome von der Tausend. Nature 2010; 467:1026-1027. Lynch et al. Die Kosten für die Reduzierung ab RNA-Menge travel guide to amsterdam für Illumina BeadArrays: Eine Perle-Level-Verdünnung Experiment. Bioinformatik BMC Genomics travel guide to amsterdam 2010, 11:540 Git et al. Systematischer Vergleich von Microarray-Profiling, real-time PCR und der nächsten Generation Sequenzierung Technologien zur Messung von Differenz microRNA Expression. RNA 2010; 16:991-1006. Curtis et al. Die Tücken der Plattform Vergleich: DNA Kopienzahl Array-Technologien beurteilt. BMC Genomics 2009, 10:588 (8. Dezember 2009) Schmidt travel guide to amsterdam et al. ChIP-seq: mit Hochdurchsatz-Sequenzierung, um Protein-DNA-Wechselwirkungen zu entdecken. travel guide to amsterdam Methoden. 2009 48 (3) :240-8. Das et al. Piwi und piRNAs Akt vor einem endogenen siRNA Weg zu Tc3 Transposon-Mobilität im Caenorhabditis elegans Keimbahn zu unterdrücken. Molecular Cell 2008; 31:79-90 Smith et al. STS-Marker für Weizen Gelbrost Resistenzgen Yr5 schlagen eine NBS-LRR-Typ Widerstand Genclusters. Genoms. 2007 Mar; 50 (3) :259-65. Marquardt et al. Weitere Ziele der Arabidopsis autonomen Signalweg Mitglieder, FCA und FY. J Exp Bot. 2006; 57 (13) :3379-86. Mitra et al. Eine Ca2 + / Calmodulin-abhängige Proteinkinase für symbiotischen Knoten travel guide to amsterdam Entwicklung erforderlich: Gene Identifizierung durch transcript-basierte Klonen. Proc Natl Acad Sci USA. 2004 Mär 30; 101 (13) :4701-5. Koebner et al. Large-scale Mutagenese an spezifischen Chromosomen in Weizen gerichtet. Genoms. 2001 Feb; 44 (1) :45-9. Jennings et al. Ein Differential-PCR-Assay zum Nachweis von c-erbB 2-Amplifikation in einer prospektiven Studie von Brustkrebs eingesetzt. Mol Pathol. 1997 Okt; 50 (5) :254-6.

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